Щель между стеной и стяжкой можно не заделывать. Напольное покрытие скроет сей несимпатичный артифакт. Ну а уж если очень хочется, можно заполнить герметиком (полиуретановым или каучуковым) или монтажной пеной - смотря какая цель данного мероприятия.